Jamagami je rekao policiji da je Abea ubio zbog njegovih veza sa jednom verskom organizacijom, koju Jamagami mrzi. Njegova izjava i drugi dokazi ukazuju da je Jamagami bio uznemiren jer je njegova majka davala velike donacije Unifikacionoj crkvi, poznatoj i kao Munova sekta, zbog čega je porodica bankrotirala.

Abeovo ubistvo usmerilo je pažnju na veze njegove partije i njega lično za konzervativnom Munovom sektom.

Članovi glavne opozicione Ustavne demokratske partije potvrdili su danas da će zatražiti istragu o tome kako je verska organizacija uticala na primedbe Abeove partije na uvođenje istopolnih brakova i odobravanje bračnim parovima da ne dele isto prezime.

Munova sekta osnovana je u Seulu 1954. godinu dana od kraja Korejskog rata. Osnovao ju je Sun Mjung Mun, samoproglašeni mesija. Učenje sekte temelji se na Munovim interpretacijama Biblije i konzervativnom sistemu vrednosti fokusiranom na porodicu i protivljenje komunizmu.

Abe je u septembru 2021. javno pohvalio rad sektine Fondacije za univerzalni mir.

Veze Munove sekte i Abeove vladajuće partije, koja je na vlasti u Japanu, sežu do Abeovog dede, bivšeg premijera Nobusukea Kišija.